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Text File  |  1995-03-04  |  1.3 KB  |  25 lines
  1. ***************************************************
  2. * Bacterial-type phytoene dehydrogenase signature *
  3. ***************************************************
  4.  
  5. Phytoene dehydrogenase  (phytoene  desaturase)  is  an  enzyme  of  carotenoid
  6. biosynthesis that  converts  phytoene  into  zeta-carotene via the symmetrical
  7. introduction of  two double bonds at the C-11 and C-11' positions of phytoene.
  8. The sequence  of  phytoene dehydrogenase from bacteria (gene crtI or carC) and
  9. fungi (gene AL-1) are not related to that from cyanobacteria and plants but is
  10. evolutionary related [1] to that of another enzyme of carotenoid biosynthesis,
  11. methoxyneurosporene dehydrogenase (gene crtD).
  12.  
  13. There are  two  glycine-rich  conserved regions, both of which probably play a
  14. role in the binding of either FAD or NAD. The first conserved region is in the
  15. N-terminal section  while the second one is in the C-terminal section. We have
  16. used the second region as a signature pattern.
  17.  
  18. -Consensus pattern: [FYW]-[LIVMF]-x-G-[AG]-[GS]-[STA]-H-P-G-[STA]-G-[LIVM]
  19. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  20. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  21. -Last update: June 1994 / First entry.
  22.  
  23. [ 1] Bartley G.E., Schmidhauser T.J., Yanofsky C., Scolnik P.A.
  24.      J. Biol. Chem. 265:16020-16024(1990).
  25.